En este museo se expone una muestra que describe los albores de la presencia fraciscana en lo que ahora se conoce como la Ciudad de México. El museo resguarda obras propiamente del templo, entre los que se encuentran documentos notables, esculturas, pinturas, un recorrido fotográfico por la historia arquitectónica, incluso del mismo barrio.

Cinco salas en las que se muestran los antecedentes arqueológicos del barrio, destacando que fue la tierra de Moctezuma y la historia de San Sebastián.
La primera es sobre el Antecedente arqueológico de Atzacoalco y la casa de infancia de Moctezuma.
La segunda es Hagiografía de San Sebastián Mártir y en donde se puede apreciar una pila buatismal del Siglo XVIII.
La tercera sala es sobre los 500 años de la presencia de la franciscana.
La cuarta sala contempla la fundación de San Sebastián Atzacoalco como barrio y doctrina de indios, donde se muestra una reliquia de 1523, el libro de fundaciones, así como libros de bautismo de indios, defunciones y matrimonios.
La quinta es en el hospital antiguo en donde a través de fotografías se puede apreciar la vida de historia del templo parroquial de San Sebastián Mártir.

16 de julio de 2023