Museo de sitio, con piezas provenientes directamente de los trabajos de investigación arqueológicos realizados en la zona arqueológica, cuenta con un total de 263 piezas que forman parte de la colección permanente, distribuidas y exhibidas alrededor de las 6 salas localizadas en la primera planta. La segunda planta está destinada a las colecciones y presentaciones de obras temporales.

El museo cuenta con dos pisos

• Sala 1: Bienvenidos a Palenque
• Introducción al área geográfica de la zona arqueológica
• Sala 2: La Acrópolis Sur
• Representaciones glíficas durante el gobierno de K´inich Ahkal Mo´Nahb´
• Sala 3: El Grupo de las Cruces
• Ilustra las creencias y costumbres religiosas de Palenque
• Sala 4: La Morada de los Muertos
• Integrada por piezas cerámicas y ornamentos localizados en recintos mortuorios
• Sala 5: El Palacio
• Incluye monumentos labrados con escenas palaciegas e inscripciones glíficas que refieren al nacimiento, entronización y rituales de varios gobernantes
• Sala 6: Las unidades habitacionales
• Contiene figurillas, portaincensarios, esculturas, enseres domésticos y otros objetos procedentes de los espacios residenciales que rodean el núcleo arquitectónico de Palenque

• 1.- Pasillo de Bienvenida
• 2.- Área de maqueta de Campamento Alberto Ruz L´huillier
• 3.- Pasillo

• Lámparas
• Focos tubulares de alógeno
• Focos y faros Led
• Lámparas tubulares Led

• Extrema humedad
• lluvias todo el año
• Vegetación selvática

• Talleres en área de comunicación educativa, en escuelas y comunidades
• Biblioteca física
• Conferencias y pláticas en auditorio
• Auditorio con acceso previa solicitud
• Visitas guiadas en museo y zona arqueológica