Ubicado en el Ex-convento de San Miguel Zinacantepec, construido durante el siglo XVI por la orden de los franciscanos. Mantuvo esa función hasta 1860, año en que fue convertido en casa cural. Declarado monumento nacional en 1934 y restaurado de 1977 a 1980. Abrió sus puertas como museo a mediados de 1980, con el objeto de preservar y difundir el acervo colonial y virreinal de Zinacantepec.
El complejo arquitectónico del museo está conformado por atrio, capilla abierta, bautisterio, anteportería y portería, claustro bajo, sala de profundis, anterrefectorio y refectorio, alacena, cocina, despensa, claustro alto, pasillo ambulatorio, celdas (dos normales y una principal), biblioteca, sala de virreyes, corredor de claustro alto, celda de oración o sala de capítulos, sala de visitas importantes y sala de exposiciones temporales.

Cuenta cn 20 salas permanentes en las que a través de pinturas, objetos y utensilios antiguos, se recrea la vida en los conventos franciscanos.

Tiene una sala para exposiciones temporales.

Tiene auditorio y librería.

5 de julio de 1980