El archivo está clasificado por secciones y series; y ordenado de forma cronológica. Cuenta con las secciones Gobierno y Hacienda y los Fondos incorporados de Justicia que pertenece al Poder Judicial Estatal y Registro Civil del Poder Ejecutivo Estatal, Sección Gobierno son notables las series Agricultura, Correspondencia, Estadística, Ganadería, Iglesias y Seguridad pública. Fondo Justicia destacan las series Causas civiles y criminales, Compra venta y Correspondencia. Esta última serie cuenta con el documento más antiguo, referente a las comunicaciones de entrada y salida de 1824.