Formar y consolidar la formación de investigadores profesionales de calidad que demuestren alto grado de originalidad, creatividad y actitud reflexiva, así como un gran rigor analítico y capacidad para la realización de investigaciones de punta y frontera en los diversos campos de la Historia y la Etnohistoria y en las acciones que garanticen la permanencia del patrimonio cultural y sus diferentes àmbitos de aplicación, destacando la gestión y difusión de este patrimonio. Los distintos enfoques se abordan con apoyo en las metodologías y tecnologías más recientes, aprovechadas desde la perspectiva de cada campo de investigación de competencia para construir y multiplicar actividades interdisciplinarias.
El programa de Maestría está estructurado de manera escolarizada a través de cursos y seminarios en los que se aprende y cuestiona el conocimiento histórico y etnohistórico. Los seminarios teóricos abordan problemas epistemológicos, teoría antropológica y la relación entre la historia y otras disciplinas afines (antropología, lingüística, arqueología, crítica literaria, etc.).