La historiografía mexicana actual se ha diversificado como ya se esperaba: ante la creciente formación de historiadores aumentó la explotación temática en la historia de México. Muchos miembros de esas nuevas generaciones se han inclinadopor estudiar el periodo colonial. En él se pueden encontrar los más diversos tópicos. Los específicamente colonial ya es parte del desarrollo historiográfico actual. Uno de los temas más trabajados de este periodo es ecerca de la institución eclesiástica en muchas de sus variantes: economía, religiosidad, antropología de la religión, educación, sociedad y otras.