La biblioteca ofrece un amplio acervo bibliohemerográfico especializado en las áreas de ciencias sociales, medio ambiente, agroforestería, suelos, pesquerías, fauna silvestre, ecología, antropología física, nutrición y migración entre otras disciplinas. Asimismo, resguarda una colección especial dedicada a Calakmul. Entre los servicios que brinda se encuentran la consulta y referencia, tanto presencial como virtual; el acceso al catálogo público; la consulta del acervo impreso y de recursos electrónicos; el préstamo de libros; la formación de usuarios; las asesorías y servicios de apoyo a la investigación, así como la realización de visitas guiadas. Además, cuenta con espacios especializados como la mapoteca, la hemeroteca, las colecciones especiales, la colección de consulta y áreas de consulta en sala.

La biblioteca ofrece una amplia gama de servicios orientados a facilitar el acceso a la información y apoyar las actividades académicas y de investigación de su comunidad usuaria. Entre ellos se encuentran el préstamo interbibliotecario, que permite obtener materiales disponibles en otras bibliotecas; el préstamo dentro de la biblioteca para la consulta en sala; conexión inalámbrica a internet; acceso a libros y revistas electrónicas; así como equipo de cómputo destinado a la consulta de recursos de información y al apoyo de las actividades de estudio e investigación.

El Sistema de Información Bibliotecario (SIBE) de El Colegio de la Frontera Sur (ECOSUR), Unidad Campeche, se integró en 1996 como parte de la red de unidades de información de la institución, con el propósito de brindar soporte documental especializado a la investigación en ciencias sociales, manejo de recursos costeros y desarrollo regional. Desde su creación, forma parte de un sistema bibliotecario coordinado que fortalece las actividades de investigación científica que ECOSUR desarrolla en la frontera sur de México. Durante varios años, la Unidad Campeche operó en el Centro Histórico de la ciudad de Campeche. En 2012, sus actividades se trasladaron a las instalaciones ubicadas en el poblado de Lerma, donde actualmente se encuentra la biblioteca. El edificio forma parte del complejo científico y operativo de la Unidad Campeche y fue diseñado para integrar laboratorios, áreas administrativas y la biblioteca especializada del SIBE, proporcionando la infraestructura necesaria para apoyar las actividades académicas y de investigación de la institución.