El edificio en donde se aloja funcionó en sus inicios como presidio y fuerte militar; fue construido alrededor de 1576 por órdenes del virrey Martín Enríquez de Almanza y reconstruido a finales del siglo XVI por Luis Carbajal y de la Cueva. El inmueble fue remodelado en 1990 y desde su fundación como museo, el 9 agosto de 1991, exhibe una colección de piezas que abarcan desde el periodo prehistórico hasta la época de la Reforma; entre ellas se encuentra una serie de grabados y objetos relacionados con los diversos grupos humanos que poblaron la Sierra Gorda.
Cuenta con módulos de exhibición, librería, sala audiovisual, sala de exposiciones temporales, centro de documentación, biblioteca y hemeroteca. Organiza actividades didácticas, ecológicas y de promoción cultural.

Mediante el arte y las técnicas de la museografía moderna, a través de una rica variedad de grabados y objetos antiguos y contemporáneos, el museo ofrece un panorama de la acción transformadora de los diversos grupos humanos que han poblado la Sierra Gorda desde los tiempos más remotos hasta nuestro siglo, entre ellos el de los pames pobladores más antiguos que han sobrevivido hasta nuestros días en algunas comunidades de Tancoyol y en el mestizaje de la población mayoritaria de la Sierra Gorda. La última sala, de carácter etnográfico, es un homenaje a esa sobrevivencia.

Una de sus salas está dedicada a la interpretación de la Reserva de la Biosfera y cuenta también con varias piezas prehispánicas que se localizaron en los alrededores de esta población así como documentos, fotografías y mapas antiguos de la región.

9 de agosto de 1991